Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc58Q8R3Q6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms