Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc12Q8R344 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc12Q8R344 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc12Q8R344 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms