Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4G1

Ltbp4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp4Q8K4G1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ltbp4Q8K4G1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ltbp4Q8K4G1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ltbp4Q8K4G1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ltbp4Q8K4G1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Ltbp4Q8K4G1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ltbp4Q8K4G1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ltbp4Q8K4G1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ltbp4Q8K4G1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ltbp4Q8K4G1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ltbp4Q8K4G1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ltbp4Q8K4G1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ltbp4Q8K4G1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ltbp4Q8K4G1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ltbp4Q8K4G1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ltbp4Q8K4G1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ltbp4Q8K4G1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ltbp4Q8K4G1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ltbp4Q8K4G1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ltbp4Q8K4G1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ltbp4Q8K4G1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ltbp4Q8K4G1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ltbp4Q8K4G1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms