Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
OptnQ8K3K8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
OptnQ8K3K8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
OptnQ8K3K8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OptnQ8K3K8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms