Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MyripQ8K3I4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MyripQ8K3I4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MyripQ8K3I4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms