Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ssh3Q8K330 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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Ssh3Q8K330 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Ssh3Q8K330 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Ssh3Q8K330 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Ssh3Q8K330 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ssh3Q8K330 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ssh3Q8K330 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
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