Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trappc12Q8K2L8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Trappc12Q8K2L8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trappc12Q8K2L8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms