Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lmbrd1Q8K0B2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lmbrd1Q8K0B2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms