Protein–RNA interactions for Protein: Q8HWB2

H2-Q4, Histocompatibility 2, Q region locus 4, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q4Q8HWB2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
H2-Q4Q8HWB2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
H2-Q4Q8HWB2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
H2-Q4Q8HWB2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms