Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Znf628Q8CJ78 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Znf628Q8CJ78 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Znf628Q8CJ78 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms