Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip10Q8CJ53 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trip10Q8CJ53 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms