Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIM1

Lrrc45, Leucine-rich repeat-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc45Q8CIM1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc45Q8CIM1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc45Q8CIM1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc45Q8CIM1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc45Q8CIM1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc45Q8CIM1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc45Q8CIM1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms