Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cog3Q8CI04 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cog3Q8CI04 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cog3Q8CI04 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Cog3Q8CI04 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog3Q8CI04 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog3Q8CI04 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog3Q8CI04 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog3Q8CI04 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog3Q8CI04 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog3Q8CI04 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog3Q8CI04 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog3Q8CI04 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cog3Q8CI04 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog3Q8CI04 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog3Q8CI04 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog3Q8CI04 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog3Q8CI04 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog3Q8CI04 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog3Q8CI04 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog3Q8CI04 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cog3Q8CI04 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms