Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE20

9030612E09Rik, RIKEN cDNA 9030612E09, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030612E09RikQ8CE20 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
9030612E09RikQ8CE20 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
9030612E09RikQ8CE20 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms