Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc87Q8CDL9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc87Q8CDL9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc87Q8CDL9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms