Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ9

Phf20l1, PHD finger protein 20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf20l1Q8CCJ9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Phf20l1Q8CCJ9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Phf20l1Q8CCJ9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Phf20l1Q8CCJ9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phf20l1Q8CCJ9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phf20l1Q8CCJ9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phf20l1Q8CCJ9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Phf20l1Q8CCJ9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Phf20l1Q8CCJ9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms