Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBM3

Gm16223, MCG145574 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16223Q8CBM3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm16223Q8CBM3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm16223Q8CBM3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms