Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAI1

Ccdc142, Coiled-coil domain-containing protein 142, mousemouse

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc142Q8CAI1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc142Q8CAI1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc142Q8CAI1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc142Q8CAI1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc142Q8CAI1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc142Q8CAI1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc142Q8CAI1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc142Q8CAI1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc142Q8CAI1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc142Q8CAI1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc142Q8CAI1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc142Q8CAI1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc142Q8CAI1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc142Q8CAI1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc142Q8CAI1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc142Q8CAI1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc142Q8CAI1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc142Q8CAI1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc142Q8CAI1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms