Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vwc2Q8C8N3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vwc2Q8C8N3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vwc2Q8C8N3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vwc2Q8C8N3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vwc2Q8C8N3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vwc2Q8C8N3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vwc2Q8C8N3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vwc2Q8C8N3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vwc2Q8C8N3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vwc2Q8C8N3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vwc2Q8C8N3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms