Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930504O13RikQ8C5Z9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930504O13RikQ8C5Z9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930504O13RikQ8C5Z9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930504O13RikQ8C5Z9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930504O13RikQ8C5Z9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930504O13RikQ8C5Z9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930504O13RikQ8C5Z9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930504O13RikQ8C5Z9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930504O13RikQ8C5Z9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
4930504O13RikQ8C5Z9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930504O13RikQ8C5Z9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930504O13RikQ8C5Z9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930504O13RikQ8C5Z9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930504O13RikQ8C5Z9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930504O13RikQ8C5Z9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930504O13RikQ8C5Z9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930504O13RikQ8C5Z9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
4930504O13RikQ8C5Z9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
4930504O13RikQ8C5Z9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms