Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y0

4930572O03Rik, RIKEN cDNA 4930572O03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930572O03RikQ8C5Y0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
4930572O03RikQ8C5Y0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
4930572O03RikQ8C5Y0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
4930572O03RikQ8C5Y0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
4930572O03RikQ8C5Y0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
4930572O03RikQ8C5Y0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
4930572O03RikQ8C5Y0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
4930572O03RikQ8C5Y0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
4930572O03RikQ8C5Y0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
4930572O03RikQ8C5Y0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
4930572O03RikQ8C5Y0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
4930572O03RikQ8C5Y0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4930572O03RikQ8C5Y0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4930572O03RikQ8C5Y0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
4930572O03RikQ8C5Y0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
4930572O03RikQ8C5Y0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
4930572O03RikQ8C5Y0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
4930572O03RikQ8C5Y0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
4930572O03RikQ8C5Y0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms