Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc113Q8C5T8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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Ccdc113Q8C5T8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc113Q8C5T8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc113Q8C5T8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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