Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slx1bQ8BX32 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slx1bQ8BX32 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slx1bQ8BX32 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.6 ms