Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ5

Dclk3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk3Q8BWQ5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclk3Q8BWQ5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclk3Q8BWQ5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dclk3Q8BWQ5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk3Q8BWQ5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk3Q8BWQ5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk3Q8BWQ5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk3Q8BWQ5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk3Q8BWQ5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk3Q8BWQ5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk3Q8BWQ5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk3Q8BWQ5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk3Q8BWQ5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dclk3Q8BWQ5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dclk3Q8BWQ5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dclk3Q8BWQ5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dclk3Q8BWQ5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dclk3Q8BWQ5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dclk3Q8BWQ5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dclk3Q8BWQ5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dclk3Q8BWQ5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms