Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Triml1Q8BVP1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Triml1Q8BVP1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Triml1Q8BVP1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms