Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx17Q8BVL3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx17Q8BVL3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx17Q8BVL3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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