Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pggt1bQ8BUY9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Pggt1bQ8BUY9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pggt1bQ8BUY9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pggt1bQ8BUY9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms