Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUV3

Gphn, Gephyrin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GphnQ8BUV3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GphnQ8BUV3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GphnQ8BUV3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GphnQ8BUV3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GphnQ8BUV3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GphnQ8BUV3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GphnQ8BUV3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
GphnQ8BUV3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GphnQ8BUV3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms