Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nlrp4aQ8BU40 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nlrp4aQ8BU40 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp4aQ8BU40 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp4aQ8BU40 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp4aQ8BU40 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp4aQ8BU40 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nlrp4aQ8BU40 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms