Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU27

Ppm1m, Protein phosphatase 1M, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppm1mQ8BU27 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppm1mQ8BU27 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ppm1mQ8BU27 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ppm1mQ8BU27 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms