Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc38a9Q8BGD6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Slc38a9Q8BGD6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc38a9Q8BGD6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms