Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sh3bgrl2Q8BG73 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms