Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tmem39bQ810L4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tmem39bQ810L4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem39bQ810L4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem39bQ810L4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem39bQ810L4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms