Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ChfrQ810L3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ChfrQ810L3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ChfrQ810L3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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