Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pcsk9Q80W65 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcsk9Q80W65 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcsk9Q80W65 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pcsk9Q80W65 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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