Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atf7ipQ7TT18 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atf7ipQ7TT18 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atf7ipQ7TT18 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms