Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
IfnkQ7TSL0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IfnkQ7TSL0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IfnkQ7TSL0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms