Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdh8Q7TSK3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdh8Q7TSK3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdh8Q7TSK3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pcdh8Q7TSK3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pcdh8Q7TSK3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pcdh8Q7TSK3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pcdh8Q7TSK3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.9 ms