Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LnpkQ7TQ95 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LnpkQ7TQ95 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LnpkQ7TQ95 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LnpkQ7TQ95 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LnpkQ7TQ95 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms