Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmc3Q7TQ69 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmc3Q7TQ69 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmc3Q7TQ69 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms