Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Shq1Q7TMX5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Shq1Q7TMX5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Shq1Q7TMX5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Shq1Q7TMX5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
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