Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sys1Q78S06 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sys1Q78S06 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms