Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nme8Q715T0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nme8Q715T0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nme8Q715T0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms