Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rpl35Q6ZWV7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl35Q6ZWV7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms