Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ58

Larp1, La-related protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,072 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1Q6ZQ58 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Larp1Q6ZQ58 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Larp1Q6ZQ58 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Larp1Q6ZQ58 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Larp1Q6ZQ58 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Larp1Q6ZQ58 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Larp1Q6ZQ58 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Larp1Q6ZQ58 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Larp1Q6ZQ58 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Larp1Q6ZQ58 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Larp1Q6ZQ58 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Larp1Q6ZQ58 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Larp1Q6ZQ58 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Larp1Q6ZQ58 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Larp1Q6ZQ58 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Larp1Q6ZQ58 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Larp1Q6ZQ58 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms