Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NinlQ6ZQ12 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NinlQ6ZQ12 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NinlQ6ZQ12 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NinlQ6ZQ12 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NinlQ6ZQ12 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NinlQ6ZQ12 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NinlQ6ZQ12 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NinlQ6ZQ12 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NinlQ6ZQ12 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NinlQ6ZQ12 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NinlQ6ZQ12 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NinlQ6ZQ12 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NinlQ6ZQ12 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NinlQ6ZQ12 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NinlQ6ZQ12 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NinlQ6ZQ12 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NinlQ6ZQ12 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
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