Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ino80Q6ZPV2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ino80Q6ZPV2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Ino80Q6ZPV2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms