Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPT1

Klhl9, Kelch-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl9Q6ZPT1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl9Q6ZPT1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Klhl9Q6ZPT1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Klhl9Q6ZPT1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms