Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnt1Q6ZPR4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Kcnt1Q6ZPR4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnt1Q6ZPR4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnt1Q6ZPR4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Kcnt1Q6ZPR4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kcnt1Q6ZPR4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kcnt1Q6ZPR4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kcnt1Q6ZPR4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Kcnt1Q6ZPR4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kcnt1Q6ZPR4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kcnt1Q6ZPR4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms