Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slc44a1Q6X893 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc44a1Q6X893 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc44a1Q6X893 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms